种子保存是农作物种质资源保存的主要方式。在葡萄种质资源保存上，种子保存主要适用于用作科研材料和砧木类型的葡萄种质材料保存。1988年，葛云香等将山葡萄种子在液态氮中保存4年以后进行播种，种子发芽和生长仍然正常。

种子保存方便易行，是今后葡萄野生种质材料保存中值得重视的一个方法。由于葡萄属于异花授粉作物，且童期较长，因此，从育种应用方面来讲，葡萄种子保存有许多不便。