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有国家重点保护植物37科，72属，105种；兽类9目，29科，120种，两栖爬行类91种，鸟类338种。兽类中，有32种属于珍稀濒危种；两栖爬行动物中，属于国家重点保护的有8种。
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金平分水岭于2001年7月被列为国家级自然保护区，总面积4.2万公顷，占红河州金平苗族瑶族傣族自治县国土面积的11%。保护区内有国内面积最大且保持完整的原始状态山地苔藓常绿阔叶林。
