现址位于杭州市下城区西湖文化广场，历经几代自博人艰辛努力地传承、积累和探索，业已发展成为一个理念先进、国内一流、富有浙江特色的自然博物馆。主要是一座标本库房，建筑面积3000余平方米。新建的陈列馆于1998年1月对外开放，建筑面积2000余平方米。馆内收藏着植物标本、矿物标本、水生生物标本、动物标本和两栖类标本等近10万件，其中不乏珍贵标本，如浙江临海出土的翼龙化石，是全国仅有的几件比较完整的化石标本之一。此外还有大量国家一类、二类保护动物、植物的标本，有不少还是当年建馆时采集而今已经绝种的标本。