林进屿火山地貌属于新生代陆地间断性多次火山喷发而形成的，有柱状节理玄武岩景观，有不同规模古火山口无根火山气孔群景观和海蚀熔岩湖、熔岩洞景观等。林进屿：呈椭圆形，面积0.16平方公里，海拔72.7米，全岛基本上由玄武岩构成，岛上的东北面为火山喷气口群，共有16个火山喷气口。

　　南碇岛：离海岸约6.5公里，椭球形，面积0.07平方公里，海拔51.5米，全岛由140万支柱状节理极其发育的墨绿色玄武岩石林构成，是目前已知世界最大、最密集的玄武岩石柱群。全岛由柱状节理及其发育的墨绿色玄武岩石林构成，远远望去，犹如镶嵌在蓝天碧海之中的一块墨玉。

　　岛上大片的悬崖峭壁，全由高高悬挂的玄武岩石柱组成，密集排列的石柱像凝固的瀑布。地质学家认为，漳州火山地貌大多经历多次火山喷发，而离海岸最远的南碇岛很可能形成于其中最强劲的一次。喷发出的岩浆在冷凝过程中，形成了一根根整齐排列的石柱，地质学上称为玄武岩柱状节理。南碇岛火山奇观为国内仅见。