圣佑庙主体建筑，殿宽17米，7开间，平面正方形，大出桅，高举折，陡屋顶，四角飞檐呈龙头探海之势，檐下斗拱，为多层挑枋肩之，工程精细，鎏金沥粉，雕梁画栋，金碧辉煌，巨柱擎起的殿廊上绘有珍禽异兽，猛虎雄狮，金鹿麒麟，凤凰弥猴，千恣百态，大殿正壁还绘有二龙戏珠，凤凰比翼，子牙钓鱼，苏武牧羊等我国传统风格的壁画，实在令人惊叹。

　　昭苏圣佑庙为全国重点文物保护单位。