遗址西距沪杭高速公路100米。南河浜遗址分布面积较广，呈东西走向，由几块高地组成，现有面积约2万平方米。南河浜南面的陶墩遗址，相对周围水田高约6米，东西长约80米，南北宽约40米，面积约3200平方米。陶墩遗址与南河浜遗址应是一个整体。两处遗址总面积约75000平方米，集中在南北长约300米，东西宽250米的区域内。

　　1996年4月至11月，为配合沪杭高速公路建设，浙江省文物考古研究所组成考古队对南河浜遗址进行抢救性发掘。实际发掘面积约1000平方米，发现崧泽文化时期人工堆筑的土台一处，清理墓葬96座，房屋7座和灰坑26个，出土陶器、石器、骨器、玉器等类文物700余件，尤其是在崧泽文化发现和研究方面取得丰硕成果。发掘范围分作A、B两区，在A区布10×10米探方8个，在B区西距A区30米处，布10×10米探方2个，总发掘面积约1000平方米。在A区共清理良渚文化墓葬4座、崧泽文化墓葬85座、灰坑22座、房屋遗迹7座以及崧泽文化的祭台1座。

　　遗址包含了从崧泽文化早期到晚期连续不断的发展过程，为认识崧泽文化的发展演变期提供了很好的资料，也为后人研究崧泽文化提供了一把有意义的时间标尺。南河浜遗址被评为1996年中国十大考古新发现奖。2006年南河浜遗址作为新石器时期的古遗址，被国务院列入第六批全国重点文物保护单位。南河浜遗址为全国重点文物保护单位。